首批装机!

4月6日

首批PacBio Revio设备

顺利入驻入区企业浩瑞基因

并于今日下机第一批实测样本数据

作为基因测序产业战略装备,PacBio Revio是解决三代测序应用难题的“多面手”,无论是学术领域方面关注的动植物基因组、单细胞研究,还是医疗科学领域,都可以基于三代测序深入研究。相比上一代PacBio Sequel II,PacBio Revio通量更大、芯片更优、读长更长,在有效提升HiFi技术准确性同时,效率达到了近乎三倍以上,为学术学界攻关、医疗产品研发、疑难杂症攻克,提供了更多可能。

浩瑞基因本次检测共测试样品2个:某种植物样本,某种动物样本。从数据结果来看,按照官方实验流程,Revio的实测数据HiFi产出90Gb,平均读长大于15Kb(平均读长根据样本质量情况会有一定差异),数据质量≥Q30。这与Revio发布的演示数据相符,说明该设备性能质量稳定,实际装机的数据达到官方宣传标准。

值得一提的是,本次实测过程中浩瑞基因严格按照PacBio的官方标准流程进行实验操作,意味着未来可优化空间较大。根据过去三年浩瑞基因在Sequel II上累积的经验,在浩瑞自行开发的提取建库以及上机公式策略的辅助之下,相信会进一步的在Revio上产生更亮眼的数据。

结果显示:Revio的HiFi产出约三倍于Sequel II,数据质量及准确性达到Sequel II标准。同时,两个系统对文库的测序没有显著的偏好,在插入读长等方面表现一致。

“未来,在浩瑞基因的进一步优化下,加上单Gb数据的测序成本大幅度的下降,相信Revio的潜力可以进一步被挖掘,期待Revio在大规模泛基因组研究,小基因组混合样本测序,人类遗传性疾病基因组学研究,以及基于单细胞技术的基因组学研究方面,大放异彩”,浩瑞基因相关负责人说。

自入驻沣东新城科统区以来,浩瑞基因借助沣东新城采购的PacBio Sequel II大力拓展临床医学及科技服务方向研究,于2022年推出“移瑞优”,基于第三代单分子测序优势,有望重新树立HLA分型“金标准”。并在生命科学研究领域已服务上百家客户,广泛涉及不同类群的动植物基因组样本,HiFi数据高产且质量稳定,尤其是在复杂/疑难样本上表现突出,且陆续在单cell产出刷新世界记录,近期在某动物样本原始subreads产出714.91G,HIFI数据近50G。

此次首批PacBio Revio设备顺利装机启用,在标志着浩瑞基因获得行业认可、拓宽行业市场同时,同步反映了浩瑞基因在沣东新城科统区支持下逐渐壮大,为企业未来发展奠定了充分信心。

“在沣东新城支持下,我们背靠秦创原创新驱动平台还成功入选了2022年度‘科学家+工程师’名单,使我们取得了进一步发展”。

浩瑞基因负责人介绍,在浩瑞基因拳头产品“移瑞优”研发过程中,沣东新城智能计算中心解决了大量数据运算难题,还持续为浩瑞基因“单分子测序和精准医学大数据产业基地”提供了算力及存储支撑。

“植种于春、苦耕于夏、收获于秋、厚积于冬,现在,辛苦耕耘以期取得更大突破的时节已经到来,从十数人的艰难创业到如今拥有以硕博为中流砥柱的近百人专业团队,我们相信,在秦创原的春风之下,我们一定能够取得更大发展”,浩瑞基因负责人说。