党的十九大将污染防治作为决胜全面建成小康社会的三大攻坚战之一，生态环境部李干杰部长，7日谈到未来我国生态环境部工作将如何开展时谈到：职能整合实现五个打通，重点强化四大职能
长期以来，在我国生态环境保护领域，体制机制方面存在两个突出问题：第一是职能交叉重复，叠床架屋、多头治理；第二是监管者和所有者没有很好地区分开来，既是运动员又是裁判员。李干杰表示，组建生态环境部，整合分散的生态环境保护职能，充分体现了习近平总书记生态文明建设重要战略思想，尤其是体现了统筹山水林田湖草系统治理的整体系统观，实现了所有者和监管者分开，相互独立、相互配合、相互监督的要求。
李干杰说，通过职能整合，进一步充实污染防治、生态保护、核与辐射安全三大职能领域，加强统一监管，实现五个打通：一是划入原国土部门的监督防止地下水污染职责，打通了“地上和地下”；二是划入水利部门的组织编制水功能区划、排污口设置管理、流域水环境保护，以及南水北调工程项目区环境保护等职责，打通了“岸上和水里”；三是划入原海洋局的海洋环境保护职责，打通了“陆地和海洋”；四是划入原农业部门的监督指导农业面源污染治理职责，打通了“城市和农村”；五是划入发展改革委的应对气候变化和减排职责，打通了“一氧化碳和二氧化碳”。